Ип на енвд выделил ндс. должен ли он с этой суммы оплатить ндфл

Когда плательщик ЕНВД без НДС является налоговым агентом?

В общем случае единый налог на вмененный доход — спецрежим, который предполагает осуществление деятельности, подпадающей под ЕНВД без НДС, то есть налогоплательщик ЕНВД освобожден от обязанности по исчислению и уплате НДС.

Однако бывают ситуации, когда хозяйствующий субъект вынужден перечислять НДС в бюджет как налоговый агент. Обязанность организаций и предпринимателей на ЕНВД по исполнению функций налогового агента закреплена в п. 2 ст. 161 НК РФ.

Операции, при которых хозсубъект, ведущий деятельность по ЕНВД, выступает налоговым агентом:

1. При покупке товаров, работ и услуг у иностранной организации, не являющейся российским налогоплательщиком, при условии что местом реализации товаров признана территория РФ.
2. При аренде или покупке у органов власти муниципального или государственного имущества. Такие сделки признаются объектом налогообложения по НДС. Покупатель, уплачивающий единый налог, обязан исчислить сумму НДС из общей суммы выкупной стоимости или арендной платы и отдельным платежным поручением перечислить ее в бюджет.
3. При продаже конфискованного, бесхозного и иного имущества, перешедшего в государственную собственность.
4. При участии в сделке купли-продажи судна, которое после ее завершения не зарегистрировано в течение 45 дней в Российском международном реестре судов.

Помимо перечисленных случаев организации и ИП на ЕНВД в некоторых ситуациях вынуждены выписывать счет-фактуру и включать в нее НДС, чтобы не потерять контрагента, не имеющего возможности совершать сделки без налога. Если такой счет-фактура выписан, то вмененщик обязан уплатить сумму налога в бюджет и представить в ИФНС налоговую декларацию.

НДС на ЕНВД при импорте или при совмещении ОСНО и ЕНВД

Еще одно исключение, при котором ЕНВД и НДС совместимы, установлено п. 4 ст. 346.26 НК РФ. Речь идет о ввозе на территорию РФ товаров импортного производства. Порядок расчета налога и подачи декларации будет зависеть от того, с территории какой страны завозятся импортные товары.

В случае совмещения налогоплательщиком ЕНВД и общей системы (допускается п. 7 ст. 346.26 НК РФ) от уплаты НДС освобождены доходы только от той деятельности, которая попадает под единый налог. Особые условия исчисления ЕНВД и НДС такими плательщиками:

1. При приобретении товаров, стоимость которых содержит НДС, для использования в деятельности, находящейся на ЕНВД, НДС к возмещению не предъявляется, а учитывается в стоимости товаров или услуг.
2. При приобретении товаров для применения в деятельности на ОСНО плательщик вправе предъявить сумму входящего НДС к вычету в соответствии с НК РФ.
3. Совмещая уплату ЕНВД и НДС, плательщик обязан организовать раздельный учет деятельности по каждой системе налогообложения.

При уплате ЕНВД и НДС одновременно организация или ИП освобождается от ведения налогового учета только деятельности на едином налоге.

***

Итак, существуют ситуации, когда плательщики могут совмещать ЕНВД и НДС. Купив импортные товары или выписав счет-фактуру с НДС, плательщик ЕНВД обязан выделить и перечислить сумму налога. Покупая или арендуя муниципальную или государственную собственность, также необходимо выделить и уплатить сумму НДС. Пренебрежение данными обязанностями может повлечь санкции в отношении налогоплательщика в соответствии с действующим законодательством РФ. Если происходит совмещение нескольких налоговых режимов, то необходимо организовать раздельный налоговый учет по каждому режиму.

Кто обязан платить НДС? В первую очередь платить НДС обязаны организации и ИП на общей системе налогообложения. НДС для организаций на УСН. Налоговые агенты и НДС.

Организации на ОСНО

В первую очередь платить НДС обязаны организации и ИП на общей системе налогообложения. Каждый квартал такие компании сдают отчетность по НДС, а с 2014 года делать это нужно в электронном виде через интернет. Справиться с этой задачей помогает система Контур.Экстерн . В Экстерне все просто — заходите и начинайте работать. Экстерн проверит ваш отчет перед отправкой и укажет на форматные ошибки, если они есть. Даже если вы будете не за компьютером, система оповестит вас о статусе отчета по СМС.

Организации, совмещающие ЕНВД и ОСН

В случае если компания совмещает ЕНВД и общий режим налогообложения, доходы, которые она получает от деятельности на «вмененке», не облагаются НДС. Чтобы не платить налог, необходимо вести раздельный учет НДС при ОСН и ЕНВД, соблюдая следующие условия:

• если для деятельности по ЕНВД организация или ИП покупает товары (услуги) с НДС, то сумму НДС нужно учитывать в стоимости этих товаров (в том числе основных средств и нематериальных активов);
• если для деятельности на ОСН организация или ИП покупает товары (услуги) с НДС, то сумму НДС принимают к вычету в соответствии с Налоговым кодексом РФ.

Но есть некоторые затраты, при которых невозможно раздельно учитывать НДС при ЕНВД и НДС при ОСН. К таким затратам относится, к примеру, аренда офиса или оплата коммунальных платежей. В этом случае сумму «входного» НДС следует распределять пропорционально тому, как данные товары (услуги) используются в каждом из видов деятельности.

Также не нужно забывать ежемесячно не позднее 25 числа месяца, который следует за отчетным кварталом, подавать декларацию по НДС и уплачивать налог.

НДС для организаций на УСН

Предприниматели на УСН освобождены от уплаты ряда налогов: в частности, организации не платят налог на прибыль и НДС, а ИП не платят НДФЛ и налог на имущество. Но все же существует ряд исключений, при которых ООО и ИП на УСН обязаны платить НДС:

• при импорте товаров на территорию РФ;
• если налогоплательщик выставляет счет-фактуру, в котором указан НДС;
• при осуществлении операций по договору о совместной деятельности, договору доверительного управления имуществом на территории России.

В этих ситуациях необходимо платить НДС и представлять декларацию по НДС.

Если контрагент (поставщик) на ОСН указывает в счете НДС, то получатель товара на УСН может спокойно оплачивать этот счет, поскольку НДС в этом случае является налогом поставщика. Покупатель на УСН (вне зависимости от варианта налогообложения) не обязан платить налог и представлять декларацию по НДС. Товар, закупленный с НДС, продавать нужно без учета суммы НДС.

Организации на УСН, ЕНВД, патенте, которые выставили покупателю счет-фактуру с НДС

Организации и предприниматели на УСН не обязаны платить НДС, но иногда они сталкиваются с просьбой покупателя выставить счет-фактуру с НДС. Это не запрещено делать, но тогда необходимо будет уплатить эту сумму НДС и подать декларацию. Сделать это можно только в электронном виде.

Налоговые агенты

Налоговые агенты по НДС обязаны платить налог на добавленную стоимость в бюджет и сдавать декларацию. Обязанности налогового агента могут исполнять и фирмы на спецрежимах.

• приобрел товары (услуги) у иностранных компаний, которые не состоят на налоговом учете в РФ;
• реализует по посредническим договорам товары (услуги) иностранных фирм, которые не состоят на учете в России;
• арендует или покупает государственное имущество;
• покупает имущество банкрота и др. (менее распространенные случаи описаны в ).

Посредники обязаны вести журнал учета счетов-фактур

Те агенты и комиссионеры, которые применяют спецрежимы налогообложения и реализуют товары (услуги) доверителя, стоящего на учете по ОСН, обязаны вести журнал учета полученных и выставленных счетов-фактур. Эти журналы нужно сдавать в налоговую в электронном виде. Отчитываться таким образом нужно не позднее 20 числа месяца, следующего за отчетным кварталом.

Если компания работает по посредническим договорам с иностранной фирмой, не состоящей на учете в РФ, то она обязана отправлять журнал учета полученных и выставленных счетов фактур вместе с декларацией по НДС в электронном виде.

Чтобы убедиться в том, что вы сдали всю отчетность и заплатили все необходимые налоги, запросите с помощью онлайн-сервиса Контур.Экстерн официальный акт сверки с налоговой, в котором будет отражена вся информация о ваших взаиморасчетах, представленных декларациях и зачисленных в бюджет платежах.

В 2016 году особых изменений в режимах налогообложения, на которых может работать ИП, не произошло. Это: общая система налогообложения, упрощенная система налогообложения, единый налог на вмененный доход, единый сельскохозяйственный налог и патентная система налогообложения. У каждого из них свои особенности, а также плюсы и минусы. В нашей статье мы остановимся на вопросе, как ИП платит НДС, от чего он зависит, кто обязан платить, исключения из правил.

Что такое НДС

Понятие налога на добавленную стоимость в Налоговом кодексе РФ не найти. Но, исходя из определений налоговой базы, ставок и других, резюмируем, что НДС – это налог:

• косвенный – прямо от доходов налогоплательщика не зависит. Это т.н. «добавка» к стоимости производимых товаров, осуществляемых работ и оказываемых услуг;
• федеральный – полностью уплачивается в государственный бюджет;
• плательщиками являются все организации, которые работают на ОСНО (есть случаи, когда уплачивают и «упрощенцы»);
• ставка налога такая:

— 0% — ст. 164 НК;

— 10 % — здесь речь идет о товарах для детей, печатных изданий, медицинских товаров различных производителей, племенного скота, услуг по внутренним воздушным перевозкам и перевозкам ж/д транспорта общего пользования в дальнем сообщении и других;

18% — во всех остальных случаях;

• формула расчета: сумма начисленного НДС – минус вычеты = сумма по итогам периода. При значении «плюс» — уплачиваем в бюджет, при значении «минус» — предъявляем к возмещению;
• отчетность подается ежеквартально в форме декларации;
• ответственность за нарушения в этой сфере – высокие штрафы.

Иными словами , можно сказать, что это определенная часть стоимости товара, которая начисляется на всех уровнях производственного процесса и подлежит уплате при его реализации. В бюджет эта сумма уплачивается еще раньше, потому что налог со своей части стоимости сырья, которые будут задействованы в сфере производства товара, уплачивают в бюджет все, кто в нем участвует на разных этапах.

Но на практике получается, что НДС, в конце концов, платим мы с вами – конечные потребители товаров, работ и услуг. Организации удерживают данный налог и перечисляют его в бюджет.

Внедрение налога на добавленную стоимость отстранило мелкий бизнес от больших денег. Скорее всего, крупные предприятия и фирмы сначала выяснят, платит ли ИП НДС. В результате они могут отказаться работать с теми, кто таковым плательщиком не является.

Особенности уплаты НДС на разных формах НО ИП

1)ОСНО . Такого понятия в налоговом законодательстве РФ нет. Считается, что это режим, установленный по умолчанию субъекту предпринимательства, который не выбрал другую отличную от этого систему или у него нет на это оснований. Для ИП существует возможность работать одновременно на трех режимах: ОСНО, ЕНВД и патент, но виды деятельности должны в данных случаях отличаться. Считается самым невыгодным. На этом режиме ИП надо платить НДС. Отчетность сложная. Декларация по НДС сдается раз в квартал. И без специальных бухгалтерских знаний не обойтись.

НДС начисляется в случаях, когда речь идет о сбыте, безвозмездному предоставлению или для личных потребностей товаров, работ, услуг на территории РФ, а также при выполнении строительно-монтажных работ для себя и импорте товаров.

Налоговая база – стоимость реализуемых вышеуказанных наименований. Налоговые вычеты (т.е. НДС, предъявляемый поставщиками или заплаченный при импорте) могут уменьшить общую сумму налога.

От обязанностей плательщика НДС освобождаются ИП, у которых сумма выручки за 3 последних последовательных месяца не превысила 2 млн. рублей.

2)УСН . Создана специально для представителей малого бизнеса. ИП в данном случае может выбрать, как ему уплачивать налоги : с доходов (6%) или с доходов за вычетом расходов (15%). Декларация по УСН сдается раз в год. Количество нанятых людей не должно превышать 100 человек. Лимит доходов на 2016 год – 60 млн. рублей. ИП на УСН платит НДС, когда он является налоговым агентом в случаях:

• приобретения товаров у нерезидентов на территории РФ;
• приобретения или аренды госимущества;
• реализации товаров, когда ИП – посредник нерезидента в расчетных операциях.

В 2016 году субъектом предоставления декларации по НДС являются:

• ИП, которые выделяют в платежных документах этот налог;
• налоговые агенты, которые не являются плательщиками данного вида налога или при заключении договора комиссии, поручения, агентском соглашении.

На практике часто встречаются случаи, когда покупатель просит выставить документ с определением НДС. Если вы осуществили данное действие, то не забудьте заплатить необходимую сумму в бюджет и подать декларацию.

3) ЕСХН . Он предназначается для производителей сельскохозяйственной продукции. Плюс такого налога в небольшом проценте ставки (доходы за вычетом расходов) — 6%. Условие перехода, чтобы доход от с/х продукции составлял 70% общего дохода. НДС при данном режиме не уплачивается, кроме того, который подлежит уплате при экспорте товаров на таможенную территорию РФ.

4) ЕНВД – это особый режим, при котором налог платится с предположительного дохода. Т.е. реальные доходы никого не интересуют, а конкретный размер устанавливается налоговым кодексом. По общему правилу НДС платить не надо, но и здесь существуют исключения:

• при экспорте товаров на территорию РФ;
• при выставлении счетов-фактур с НДС;
• в случаях выступления в роли налогового агента.

5) ПСН . Становиться на эту систему учета можно только при осуществлении определенного вида работ и с количеством наемных сотрудников – 15 человек. Для этого вы приобретаете патент (для работы в нескольких регионах – несколько патентов) и в последующем все, что вы заработаете, будет облагаться налогом. Декларация не подается.

От уплаты НДС о свобождены, кроме:

• осуществления иных видов бизнеса (кроме ПСН);
• при ввозе товаров на территорию РФ;
• при осуществлении сделок ст. 174.1 НК

Заключение

Таким образом, даже если бизнесмен не находится на общем режиме налогообложения, он все равно имеет право выставлять счета-фактуры с указанием НДС. В этом случае необходимо сдать налоговую отчетность и заплатить налог в предусмотренном законом порядке. Смену режима в этом случае законодательство не предусматривает.

Неважно, ИП работает с НДС или без, он должен четко и своевременно осуществлять уплату налогов и предоставлять отчетность в фискальные органы.

В избранноеОтправить на почту ЕНВД и НДС на первый взгляд кажутся взаимоисключающими понятиями. Но льготное налогообложение в виде ЕНВД и НДС, взимающийся при совершении некоторых операций при вмененке, вполне могут уживаться вместе. НДС при ЕНВД в 2015–2016 годах Начисление НДС налоговыми агентами НДС при операциях импорта Выставление счета-фактуры с НДС НДС при ЕНВД в 2015–2016 годах Налогоплательщики, использующие режим ЕНВД, в соответствии с п. 4 ст. 346.26 НК РФ платить НДС не должны. Однако существуют ситуации, при которых ЕНВД и НДС совместимы и отвечают нормам законодательства. В таких случаях необходимо рассчитывать и уплачивать налог, а также своевременно представлять декларацию в налоговые органы. За нарушение этих правил для «вмененщиков» предусмотрена налоговая ответственность на общих основаниях.

Ндс при енвд

При оплате «детских» больничных придется быть внимательнее Листок нетрудоспособности по уходу за больным ребенком в возрасте до 7 лет будет оформляться на весь период болезни без каких-либо ограничений по срокам. Но будьте внимательны: порядок оплаты «детского» больничного остался прежним! < …
Онлайн-ККТ: кому можно не торопиться с покупкой кассы Отдельные представители бизнеса могут не применять онлайн-ККТ до 01.07.2019 года. Правда, для применения этой отсрочки есть ряд условий (режим налогообложения, вид деятельности, наличие/отсутствие работников).

Так кто же вправе работать без кассы до середины следующего года? < … Главная → Бухгалтерские консультации → ЕНВД Актуально на: 14 января 2016 г.

Внимание

Плательщики ЕНВД не являются плательщиками НДС, поэтому исчислять и платить его они не должны. Кроме случая, когда организация или ИП на ЕНВД ввозит товар на территорию РФ (п.

Что делать, если ип или ооо на енвд выставили счет-фактуру с ндс

При отсутствии у налогоплательщика раздельного учета сумма налога по приобретенным товарам (работам, услугам), в том числе основным средствам и нематериальным активам, имущественным правам, вычету не подлежит и в расходы, принимаемые к вычету при исчислении налога на прибыль организаций (налога на доходы физических лиц), не включается. Налогоплательщик имеет право не применять положения настоящего пункта к тем налоговым периодам, в которых доля совокупных расходов на производство товаров (работ, услуг), имущественных прав, операции по реализации которых не подлежат налогообложению, не превышает 5 процентов общей величины совокупных расходов на производство.

При каких операциях на енвд нужно платить ндс?

По виду деятельности, которая попадает под общий режим налогообложения, необходимо ежеквартально (не позже 20 числа месяца, следующего за отчётным кварталом) подавать декларацию по НДС, а также уплачивать НДС. Вы хотите вести бухгалтерский и налоговый учёт правильно и оперативно? Тогда воспользуйтесь интернет-бухгалтерией «Моё дело».

Важно

Большинство форм в сервисе заполняется автоматически, что исключает возникновение ошибок. Составление и отправка отчётности, расчёт налогов по УСН, формирование платежных поручений и даже перечисление налоговых платежей – всё это Вы без труда сможете делать в системе «Моё дело».

Енвд и ндс

Если налог не прописан в договоре, но прописана сумма сделки с пояснением, что в нее включен добавленный налог, то расчет нужно провести по формуле ниже: НДС = сумма сделки * 18 / 118 Владельцу имущества оплачивается разница между суммой из договора и посчитанным НДС. Если конкретная величина налога в договоре не прописана, но поясняется, что НДС нужно посчитать самостоятельно, то рассчитать его нужно по такой формуле: НДС = сумма сделки * 18% Владельцу оплачивается цена, прописанная в договорном соглашении.
Так как фирма на ЕНВД становится налоговым агентом в сделках, связанных с покупкой и арендой госимущества у органа власти, то возникает обязанность по составлению счета-фактуры и последующей ее фиксации в книге продаж. Перечислять налог можно одним из двух способов:

• тремя платежами по 1/3 величины посчитанного налога.

Енвд и налог на добавленную стоимость

НК РФ закрепляет, что плательщик единого налога на вмененный доход не обязан уплачивать НДС, а соответственно, и выставлять счета-фактуры. Одним из актуальных вопросов является определение налоговых последствий выставления плательщиком ЕНВД счета-фактуры с выделением в нем суммы НДС.

Например, до сих пор встречаются споры относительно утраты плательщиком ЕНВД права на его применение в случае выставления по просьбе покупателя счета-фактуры с выделенным НДС.Кроме того, остается нераскрытым вопрос: в случае если плательщик ЕНВД не теряет права на применение ЕНВД при выставлении покупателю счета-фактуры, обязан ли он перечислять НДС в бюджет?В рамках данной статьи мы проанализируем положения действующего налогового законодательства, последние и актуальные изменения, внесенные в нормы НК РФ, а также исследуем позиции официальных органов по рассматриваемой спорной ситуации.Как установлено п.

Как определяется ндс при енвд ип?

Старые «прибыльные» ошибки иногда можно исправить в текущем периоде Если организация обнаружила, что в одном из предыдущих отчетных (налоговых) периодов при исчислении налога на прибыль была допущена ошибка, исправить ее текущим периодом можно, только если соблюдены два условия. < … Сдача СЗВ-М на директора-учредителя: ПФР определился Пенсионный фонд наконец-то поставил точку в спорах о необходимости представлять форму СЗВ-М в отношении руководителя-единственного учредителя.
Так вот, на таких лиц нужно сдавать и СЗВ-М, и СЗВ-СТАЖ! < … Компенсация за неиспользованный отпуск: десять с половиной месяцев идут за год При увольнении сотрудника, проработавшего в организации 11 месяцев, компенсацию за неиспользованный отпуск ему нужно выплатить как за полный рабочий год (п.28 Правил, утв.

НКТ СССР 30.04.1930 № 169). Но иногда эти 11 месяцев не такие уж и отработанные. < …

Учёт ндс при енвд

Проект федерального закона № 419090-7 «Об альтернативных способах привлечения инвестирования (краудфандинге)»Законопроектом регулируются отношения по привлечению инвестиций коммерческими организациями или индивидуальными предпринимателями с использованием информационных технологий, а также определяются правовые основы деятельности операторов инвестиционных платформ по организации розничного финансирования (краудфандинга). Деятельность по организации розничного финансирования (краудфандинга) заключается в оказании услуг по предоставлению участникам инвестиционной платформы доступа к ее информационным ресурсам.

12 марта 2013 г.Проект Федерального закона № 410960-7 «О внесении изменений в Уголовный кодекс РФ и ст.

Выставление счёт-фактуры с ндс

Подробнее о штрафных санкциях за несдачу декларации или ее несвоевременное предоставление см. статью «Какой размер штрафа за несдачу декларации по НДС в 2014–2015 гг.». Декларация по НДС и ЕНВД, а также при ОСНО составляется по общим правилам и форме, утвержденной приказом ФНС России от 29.10.2014 № ММВ-7-3/558@.
Для налоговых агентов, уплачивающих ЕНВД и НДС, предусмотрена возможность в соответствии с п. 5 ст. 174 НК РФ не представлять декларацию по НДС в электронном виде. Подробнее о том, в каких случаях подается декларация по НДС при работе на ЕНВД, см. статью «Когда и кто подает декларацию по НДС при ЕНВД в 2014–2015 годах». Начисление НДС налоговыми агентами Параллельная уплата ЕНВД и НДС требуется организациям и ИП при их выступлении в качестве налоговых агентов. Налоговыми агентами считаются субъекты, отвечающие критериям, изложенным в п. 1 ст. 24 НК РФ.

Покупка или аренда у органов власти Если владельцем госимущества выступает МУП, ГУП или учреждение, то обязанности по уплате добавленного налога не наступает. Если же в этой роли оказывается орган власти, то компания на ЕНВД становится налоговым агентом по НДС по операциям, связанным с приобретением такого имущества в постоянное или временное пользование.

Порядок определения НДС к перечислению зависит от договорных условий. Если прописана конкретная выделенная величина налога, то ее и нужно оплатить, владельцу имущества при этом перечисляется стоимость из договора за вычетом уплаченного НДС.

Выставление ндс при енвд

К данным лицам относятся:1) лица, не являющиеся налогоплательщиками, или налогоплательщики, освобожденные от исполнения обязанностей налогоплательщика, связанных с исчислением и уплатой налога;2) налогоплательщики при реализации товаров (работ, услуг), операции по реализации которых не подлежат налогообложению.При этом сумма налога, подлежащая уплате в бюджет, определяется как сумма налога, указанная в соответствующем счете-фактуре, переданном покупателю товаров (работ, услуг).Соответственно, НК РФ допускает случаи, при которых необходимо уплатить НДС при выставлении покупателю счета-фактуры.Финансовое ведомство неоднократно подчеркивало, что п. 5 ст.

Налогового кодекса РФ. То есть это означает, что согласно пункту 4 статьи 170 Налогового кодекса РФ сумму НДС, предъявленную продавцами:

• учитывают в стоимости таких товаров (в том числе основных средств и нематериальных активов), работ, услуг при использовании их в деятельности, не облагаемой НДС;
• принимают к вычету по правилам статьи 172 Налогового кодекса РФ, если приобретенное имущество или работы и услуги используются для осуществления операций, облагаемых НДС.

Это должно происходить с купленными товарами (работами, услугами), имущественные права на которые можно отнести к определенному (облагаемому или не облагаемому НДС) виду предпринимательства. Часть затрат, понесенных фирмой, невозможно отнести ни к общему режиму, ни к операциям, по которым платят ЕНВД.

Нет, здесь речь идет именно о НДС, потому, что налоговая изначально мне позвонила и потребовала в устной форме сдать 3- НДФЛ, объяснив это тем, что у меня была уплата НДС, и декларация по данному налогу. Мой мое мнение, что Вы думаете по нему: По общему правилу плательщики ЕНВД не признаются налогоплательщиками НДС (п. 4 ст. 346.26 НК РФ). И выставление счета- фактуры покупателю (клиенту) с выделенной суммой НДС не лишает продавца (исполнителя), применяющего ЕНВД, права на применение ЕНВД.
Минфин России в Письмах от 18.04.2014 № 03-11-11/18035, от 07.08.2013 № 03-11-11/31784, от 05.07.2013 № 03-07-14/26067 по аналогичному вопросу дает следующие разъяснения: НК РФ «не содержит таких оснований для утраты права на применение системы налогообложения в виде единого налога на вмененный доход для отдельных видов деятельности, как выставление плательщиком единого налога на вмененный доход счета- фактуры».

Мои доводы в ответ на требование основываются на том, что доход от клиента, которому выставлен счет- фактуру, получен именно от оказания услуг по грузоперевозкам, то есть, от деятельности, по которой ИП стоит на учете в качестве плательщика ЕНВД, а не от какой- либо иной деятельности.

Применение ЕНВД является добровольным. И если ИП встал на учет в качестве плательщика ЕНВД по такому виду деятельности как грузоперевозки, то все доходы, полученные предпринимателем от грузоперевозок, облагаются только в рамках ЕНВД. Такие доходы не могут облагаться по ОСНО с исчислением НДФЛ только потому, что ИП выставил своему клиенту счет- фактуру. То есть, нельзя по доходам, полученным от осуществления одного вида деятельности, в течении календарного года применять разные системы налогообложения.
Помимо прочего, ИП не подавал заявление о снятии его с учета в качестве плательщика ЕНВД и о переходе по осуществляемому им виду деятельности на ОСНО. Тем более, что переход по одному виду деятельности с ЕНВД на ОСНО в добровольном режиме производится только с начала следующего года.
Вот если ИП осуществляет розничную торговлю, в отношении которой применяется ЕНВД, и при этом заключил в покупателем договор поставки с выставлением продавцу счета- фактуры, тогда доход, полученный по договору поставки следует облагать по ОСНО. Но не потому что ИП выставил счет- фактуру, а потому что заключение договора поставки уже не является розничной торговлей. Это оптовая торговля. А оптовая торговля не переводится на ЕНВД. И в такой ситуации ИП осуществляет два вида деятельности: розничную, по которой отчитывается по ЕНВД, и оптовую, по которой отчитывается по ОСНО.

Я специально привела вам этот пример, чтобы вы поняли – в чем именно заблуждаются налоговые инспектора. В моем случае у меня один вид деятельности. И не важно, выставили ли вы счет- фактуру или нет, от этого ваш вид деятельности: грузоперевозки, не меняется на другой вид деятельности.